get it into one's head that ....

「意味」．．．だと思い込む。．．．と信じ込む。

※itはthat以下の内容を指します．one'sの部分には，myやyourなどの人称代名詞の所有格が入ります．

itを（つまり，that以下の内容を）頭（head）に入れる，ということから，上記のような意味になります．

「英会話例文」
Don't get it into your head that we're friends.「僕たちが友達だなんて思い込むなよ。」